口模清理完成之后，我們取出清理桿(有兩根膠木把手所做的金屬長桿，不帶螺紋的是送料桿，用于進料時使用，帶螺紋的是清理桿)，我們找到合適厚度的布纏繞清理桿一圈，插入熔指儀料筒，自上至下進行料筒清理，需要注意的是，一定要在試驗時的溫度狀態下進行清理，否則殘留物可能會固化，從而無法清理干凈。(用于清理料筒的布，可用廢舊床單，或者廚房用紙，用于清理料筒的介質面對料筒中的較高溫度不能發生化學反應)，終的效果是料筒內部光滑透亮視為合格。
    然后是進料口和出料口的清理，用鑷子夾住抹布進行清理，清理時帶上手套，小心加熱爐燙到手，清理干凈后用抹布將其抹上機械油。
    將活塞桿，送料桿和清理桿上面粘有的塑料殘渣清理干凈即完成熔指儀的清理工作，讓儀器停止加熱，關機，并斷開電源，所有清理工作完成。